Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGP1Q92546 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGP1Q92546 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGP1Q92546 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RGP1Q92546 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGP1Q92546 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGP1Q92546 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGP1Q92546 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGP1Q92546 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RGP1Q92546 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGP1Q92546 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGP1Q92546 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGP1Q92546 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGP1Q92546 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGP1Q92546 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGP1Q92546 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGP1Q92546 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RGP1Q92546 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGP1Q92546 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RGP1Q92546 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGP1Q92546 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms