Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSC4DQ8WTU2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSC4DQ8WTU2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SSC4DQ8WTU2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSC4DQ8WTU2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSC4DQ8WTU2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSC4DQ8WTU2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSC4DQ8WTU2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSC4DQ8WTU2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSC4DQ8WTU2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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