Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF398Q8TD17 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF398Q8TD17 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF398Q8TD17 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
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