Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB3IL1Q8TBN0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3IL1Q8TBN0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3IL1Q8TBN0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB3IL1Q8TBN0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3IL1Q8TBN0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms