Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEIL3Q8TAT5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEIL3Q8TAT5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEIL3Q8TAT5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEIL3Q8TAT5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEIL3Q8TAT5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEIL3Q8TAT5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEIL3Q8TAT5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEIL3Q8TAT5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEIL3Q8TAT5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEIL3Q8TAT5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEIL3Q8TAT5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEIL3Q8TAT5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEIL3Q8TAT5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEIL3Q8TAT5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEIL3Q8TAT5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEIL3Q8TAT5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEIL3Q8TAT5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEIL3Q8TAT5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEIL3Q8TAT5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEIL3Q8TAT5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEIL3Q8TAT5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEIL3Q8TAT5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEIL3Q8TAT5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEIL3Q8TAT5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEIL3Q8TAT5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEIL3Q8TAT5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEIL3Q8TAT5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEIL3Q8TAT5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEIL3Q8TAT5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEIL3Q8TAT5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEIL3Q8TAT5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEIL3Q8TAT5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEIL3Q8TAT5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEIL3Q8TAT5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEIL3Q8TAT5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEIL3Q8TAT5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEIL3Q8TAT5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NEIL3Q8TAT5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEIL3Q8TAT5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms