Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNERQ8NFT8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNERQ8NFT8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DNERQ8NFT8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNERQ8NFT8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNERQ8NFT8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNERQ8NFT8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
DNERQ8NFT8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNERQ8NFT8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DNERQ8NFT8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DNERQ8NFT8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DNERQ8NFT8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DNERQ8NFT8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DNERQ8NFT8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DNERQ8NFT8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
DNERQ8NFT8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DNERQ8NFT8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
DNERQ8NFT8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DNERQ8NFT8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNERQ8NFT8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNERQ8NFT8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNERQ8NFT8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNERQ8NFT8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNERQ8NFT8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNERQ8NFT8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNERQ8NFT8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNERQ8NFT8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNERQ8NFT8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNERQ8NFT8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNERQ8NFT8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNERQ8NFT8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNERQ8NFT8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DNERQ8NFT8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
DNERQ8NFT8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNERQ8NFT8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DNERQ8NFT8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNERQ8NFT8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNERQ8NFT8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNERQ8NFT8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DNERQ8NFT8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNERQ8NFT8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNERQ8NFT8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNERQ8NFT8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNERQ8NFT8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNERQ8NFT8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNERQ8NFT8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DNERQ8NFT8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNERQ8NFT8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
DNERQ8NFT8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNERQ8NFT8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNERQ8NFT8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNERQ8NFT8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNERQ8NFT8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNERQ8NFT8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNERQ8NFT8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNERQ8NFT8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNERQ8NFT8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNERQ8NFT8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNERQ8NFT8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNERQ8NFT8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNERQ8NFT8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNERQ8NFT8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms