Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM1BQ8NB78 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KDM1BQ8NB78 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM1BQ8NB78 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 891 ms