Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC29Q8NA56 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC29Q8NA56 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC29Q8NA56 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC29Q8NA56 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC29Q8NA56 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms