Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DTX3Q8N9I9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DTX3Q8N9I9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DTX3Q8N9I9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms