Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFRP1Q8N474 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFRP1Q8N474 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFRP1Q8N474 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFRP1Q8N474 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFRP1Q8N474 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFRP1Q8N474 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SFRP1Q8N474 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SFRP1Q8N474 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFRP1Q8N474 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFRP1Q8N474 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFRP1Q8N474 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFRP1Q8N474 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFRP1Q8N474 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFRP1Q8N474 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFRP1Q8N474 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFRP1Q8N474 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFRP1Q8N474 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFRP1Q8N474 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SFRP1Q8N474 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFRP1Q8N474 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SFRP1Q8N474 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFRP1Q8N474 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.4 ms