Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC13Q8IYE1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC13Q8IYE1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC13Q8IYE1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC13Q8IYE1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms