Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC117Q8IWD4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC117Q8IWD4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC117Q8IWD4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC117Q8IWD4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC117Q8IWD4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC117Q8IWD4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC117Q8IWD4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC117Q8IWD4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC117Q8IWD4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC117Q8IWD4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC117Q8IWD4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC117Q8IWD4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC117Q8IWD4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC117Q8IWD4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC117Q8IWD4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC117Q8IWD4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC117Q8IWD4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC117Q8IWD4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC117Q8IWD4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC117Q8IWD4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC117Q8IWD4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms