Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
VSTM4Q8IW00 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VSTM4Q8IW00 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VSTM4Q8IW00 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VSTM4Q8IW00 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VSTM4Q8IW00 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms