Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ARID3BQ8IVW6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARID3BQ8IVW6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARID3BQ8IVW6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ARID3BQ8IVW6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms