Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM139Q8IV31 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM139Q8IV31 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM139Q8IV31 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM139Q8IV31 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM139Q8IV31 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM139Q8IV31 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM139Q8IV31 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM139Q8IV31 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM139Q8IV31 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM139Q8IV31 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM139Q8IV31 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM139Q8IV31 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM139Q8IV31 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM139Q8IV31 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM139Q8IV31 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM139Q8IV31 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM139Q8IV31 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM139Q8IV31 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM139Q8IV31 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM139Q8IV31 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM139Q8IV31 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM139Q8IV31 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM139Q8IV31 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM139Q8IV31 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM139Q8IV31 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM139Q8IV31 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM139Q8IV31 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM139Q8IV31 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM139Q8IV31 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM139Q8IV31 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM139Q8IV31 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM139Q8IV31 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM139Q8IV31 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM139Q8IV31 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM139Q8IV31 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM139Q8IV31 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM139Q8IV31 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM139Q8IV31 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM139Q8IV31 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM139Q8IV31 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM139Q8IV31 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM139Q8IV31 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM139Q8IV31 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM139Q8IV31 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM139Q8IV31 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM139Q8IV31 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM139Q8IV31 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM139Q8IV31 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM139Q8IV31 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms