Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB43Q86YS6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB43Q86YS6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB43Q86YS6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB43Q86YS6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB43Q86YS6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.1 ms