Protein–RNA interactions for Protein: Q86YH6

PDSS2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2Q86YH6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDSS2Q86YH6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDSS2Q86YH6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDSS2Q86YH6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDSS2Q86YH6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDSS2Q86YH6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDSS2Q86YH6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDSS2Q86YH6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDSS2Q86YH6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDSS2Q86YH6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDSS2Q86YH6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDSS2Q86YH6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDSS2Q86YH6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDSS2Q86YH6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDSS2Q86YH6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDSS2Q86YH6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDSS2Q86YH6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDSS2Q86YH6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDSS2Q86YH6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDSS2Q86YH6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDSS2Q86YH6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDSS2Q86YH6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDSS2Q86YH6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms