Protein–RNA interactions for Protein: Q86VW1

SLC22A16, Solute carrier family 22 member 16, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A16Q86VW1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A16Q86VW1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A16Q86VW1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A16Q86VW1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A16Q86VW1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A16Q86VW1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A16Q86VW1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A16Q86VW1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC22A16Q86VW1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC22A16Q86VW1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC22A16Q86VW1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC22A16Q86VW1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A16Q86VW1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC22A16Q86VW1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms