Protein–RNA interactions for Protein: Q86UP9

LHFPL3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL3Q86UP9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHFPL3Q86UP9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHFPL3Q86UP9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHFPL3Q86UP9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHFPL3Q86UP9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHFPL3Q86UP9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHFPL3Q86UP9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHFPL3Q86UP9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHFPL3Q86UP9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHFPL3Q86UP9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHFPL3Q86UP9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHFPL3Q86UP9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHFPL3Q86UP9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHFPL3Q86UP9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHFPL3Q86UP9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHFPL3Q86UP9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHFPL3Q86UP9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHFPL3Q86UP9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LHFPL3Q86UP9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHFPL3Q86UP9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHFPL3Q86UP9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LHFPL3Q86UP9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LHFPL3Q86UP9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms