Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF4

CCDC190, Coiled-coil domain-containing protein 190, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC190Q86UF4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC190Q86UF4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC190Q86UF4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC190Q86UF4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC190Q86UF4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC190Q86UF4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC190Q86UF4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC190Q86UF4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC190Q86UF4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC190Q86UF4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC190Q86UF4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC190Q86UF4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC190Q86UF4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC190Q86UF4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC190Q86UF4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC190Q86UF4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC190Q86UF4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC190Q86UF4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC190Q86UF4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC190Q86UF4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC190Q86UF4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC190Q86UF4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC190Q86UF4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC190Q86UF4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms