Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H3

HDDC2, HD domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC2Q7Z4H3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDDC2Q7Z4H3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDDC2Q7Z4H3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDDC2Q7Z4H3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDDC2Q7Z4H3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms