Protein–RNA interactions for Protein: Q7M4L6

SHF, SH2 domain-containing adapter protein F, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHFQ7M4L6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHFQ7M4L6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHFQ7M4L6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SHFQ7M4L6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHFQ7M4L6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHFQ7M4L6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHFQ7M4L6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHFQ7M4L6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHFQ7M4L6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHFQ7M4L6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHFQ7M4L6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHFQ7M4L6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHFQ7M4L6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHFQ7M4L6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHFQ7M4L6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHFQ7M4L6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHFQ7M4L6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHFQ7M4L6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHFQ7M4L6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHFQ7M4L6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHFQ7M4L6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHFQ7M4L6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SHFQ7M4L6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHFQ7M4L6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms