Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.25■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.19■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC40.06■■■■■ 4
HECW1Q76N89 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
HECW1Q76N89 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
HECW1Q76N89 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
HECW1Q76N89 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
HECW1Q76N89 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
HECW1Q76N89 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
HECW1Q76N89 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
HECW1Q76N89 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC40.02■■■■■ 4
HECW1Q76N89 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
HECW1Q76N89 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
HECW1Q76N89 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
HECW1Q76N89 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
HECW1Q76N89 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
HECW1Q76N89 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
HECW1Q76N89 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
HECW1Q76N89 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
HECW1Q76N89 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
HECW1Q76N89 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
HECW1Q76N89 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms