Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED13LQ71F56 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED13LQ71F56 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED13LQ71F56 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED13LQ71F56 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms