Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTL4Q6ZR62 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RTL4Q6ZR62 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTL4Q6ZR62 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTL4Q6ZR62 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTL4Q6ZR62 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTL4Q6ZR62 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTL4Q6ZR62 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTL4Q6ZR62 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTL4Q6ZR62 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTL4Q6ZR62 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTL4Q6ZR62 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTL4Q6ZR62 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTL4Q6ZR62 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTL4Q6ZR62 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms