Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF111Q6ZNA4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF111Q6ZNA4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF111Q6ZNA4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF111Q6ZNA4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms