Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJQ5

FOXR2, Forkhead box protein R2, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXR2Q6PJQ5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXR2Q6PJQ5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXR2Q6PJQ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXR2Q6PJQ5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXR2Q6PJQ5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOXR2Q6PJQ5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXR2Q6PJQ5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOXR2Q6PJQ5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXR2Q6PJQ5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXR2Q6PJQ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXR2Q6PJQ5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXR2Q6PJQ5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXR2Q6PJQ5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXR2Q6PJQ5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXR2Q6PJQ5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXR2Q6PJQ5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXR2Q6PJQ5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXR2Q6PJQ5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXR2Q6PJQ5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXR2Q6PJQ5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXR2Q6PJQ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FOXR2Q6PJQ5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXR2Q6PJQ5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXR2Q6PJQ5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXR2Q6PJQ5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXR2Q6PJQ5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXR2Q6PJQ5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXR2Q6PJQ5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXR2Q6PJQ5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXR2Q6PJQ5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXR2Q6PJQ5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXR2Q6PJQ5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXR2Q6PJQ5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXR2Q6PJQ5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXR2Q6PJQ5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXR2Q6PJQ5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXR2Q6PJQ5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXR2Q6PJQ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FOXR2Q6PJQ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXR2Q6PJQ5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXR2Q6PJQ5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXR2Q6PJQ5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXR2Q6PJQ5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms