Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RNF123Q5XPI4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RNF123Q5XPI4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RNF123Q5XPI4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RNF123Q5XPI4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RNF123Q5XPI4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RNF123Q5XPI4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
RNF123Q5XPI4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RNF123Q5XPI4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RNF123Q5XPI4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RNF123Q5XPI4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RNF123Q5XPI4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RNF123Q5XPI4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RNF123Q5XPI4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RNF123Q5XPI4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RNF123Q5XPI4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RNF123Q5XPI4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RNF123Q5XPI4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RNF123Q5XPI4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
RNF123Q5XPI4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RNF123Q5XPI4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RNF123Q5XPI4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RNF123Q5XPI4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RNF123Q5XPI4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RNF123Q5XPI4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RNF123Q5XPI4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RNF123Q5XPI4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RNF123Q5XPI4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
RNF123Q5XPI4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RNF123Q5XPI4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.93
RNF123Q5XPI4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RNF123Q5XPI4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RNF123Q5XPI4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms