Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM236Q5W0B7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM236Q5W0B7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM236Q5W0B7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM236Q5W0B7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM236Q5W0B7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms