Protein–RNA interactions for Protein: Q5W041

ARMC3, Armadillo repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC3Q5W041 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARMC3Q5W041 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARMC3Q5W041 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARMC3Q5W041 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARMC3Q5W041 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARMC3Q5W041 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms