Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF20Q5VTR2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF20Q5VTR2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF20Q5VTR2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF20Q5VTR2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF20Q5VTR2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF20Q5VTR2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RNF20Q5VTR2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RNF20Q5VTR2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RNF20Q5VTR2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RNF20Q5VTR2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF20Q5VTR2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF20Q5VTR2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF20Q5VTR2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF20Q5VTR2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF20Q5VTR2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF20Q5VTR2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RNF20Q5VTR2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms