Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC40.05■■■■■ 4
CCDC18Q5T9S5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CCDC18Q5T9S5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
CCDC18Q5T9S5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CCDC18Q5T9S5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
CCDC18Q5T9S5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CCDC18Q5T9S5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CCDC18Q5T9S5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
CCDC18Q5T9S5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CCDC18Q5T9S5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40■■■■□ 3.99
CCDC18Q5T9S5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
CCDC18Q5T9S5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
CCDC18Q5T9S5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CCDC18Q5T9S5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
CCDC18Q5T9S5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CCDC18Q5T9S5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
CCDC18Q5T9S5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CCDC18Q5T9S5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CCDC18Q5T9S5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CCDC18Q5T9S5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CCDC18Q5T9S5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CCDC18Q5T9S5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CCDC18Q5T9S5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CCDC18Q5T9S5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CCDC18Q5T9S5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CCDC18Q5T9S5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
CCDC18Q5T9S5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CCDC18Q5T9S5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CCDC18Q5T9S5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
CCDC18Q5T9S5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CCDC18Q5T9S5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CCDC18Q5T9S5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CCDC18Q5T9S5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CCDC18Q5T9S5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
CCDC18Q5T9S5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC18Q5T9S5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC18Q5T9S5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC18Q5T9S5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CCDC18Q5T9S5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.98
CCDC18Q5T9S5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CCDC18Q5T9S5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CCDC18Q5T9S5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CCDC18Q5T9S5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CCDC18Q5T9S5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CCDC18Q5T9S5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CCDC18Q5T9S5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CCDC18Q5T9S5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CCDC18Q5T9S5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CCDC18Q5T9S5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CCDC18Q5T9S5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC18Q5T9S5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC18Q5T9S5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC18Q5T9S5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC18Q5T9S5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC18Q5T9S5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC18Q5T9S5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC18Q5T9S5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
CCDC18Q5T9S5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CCDC18Q5T9S5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CCDC18Q5T9S5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CCDC18Q5T9S5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CCDC18Q5T9S5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CCDC18Q5T9S5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CCDC18Q5T9S5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CCDC18Q5T9S5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CCDC18Q5T9S5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CCDC18Q5T9S5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CCDC18Q5T9S5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CCDC18Q5T9S5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CCDC18Q5T9S5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CCDC18Q5T9S5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CCDC18Q5T9S5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CCDC18Q5T9S5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CCDC18Q5T9S5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CCDC18Q5T9S5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC18Q5T9S5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
CCDC18Q5T9S5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CCDC18Q5T9S5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CCDC18Q5T9S5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CCDC18Q5T9S5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
CCDC18Q5T9S5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms