Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC183Q5T5S1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC183Q5T5S1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC183Q5T5S1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC183Q5T5S1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC183Q5T5S1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC183Q5T5S1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC183Q5T5S1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC183Q5T5S1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC183Q5T5S1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC183Q5T5S1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC183Q5T5S1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC183Q5T5S1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC183Q5T5S1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC183Q5T5S1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC183Q5T5S1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC183Q5T5S1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC183Q5T5S1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC183Q5T5S1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC183Q5T5S1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC183Q5T5S1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC183Q5T5S1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC183Q5T5S1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC183Q5T5S1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC183Q5T5S1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC183Q5T5S1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC183Q5T5S1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC183Q5T5S1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC183Q5T5S1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC183Q5T5S1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC183Q5T5S1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC183Q5T5S1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC183Q5T5S1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC183Q5T5S1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC183Q5T5S1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC183Q5T5S1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC183Q5T5S1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC183Q5T5S1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC183Q5T5S1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC183Q5T5S1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC183Q5T5S1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC183Q5T5S1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC183Q5T5S1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC183Q5T5S1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC183Q5T5S1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC183Q5T5S1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC183Q5T5S1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC183Q5T5S1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC183Q5T5S1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC183Q5T5S1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC183Q5T5S1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC183Q5T5S1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC183Q5T5S1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC183Q5T5S1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC183Q5T5S1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC183Q5T5S1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC183Q5T5S1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms