Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CFAP70Q5T0N1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CFAP70Q5T0N1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CFAP70Q5T0N1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CFAP70Q5T0N1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFAP70Q5T0N1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFAP70Q5T0N1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFAP70Q5T0N1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFAP70Q5T0N1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFAP70Q5T0N1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFAP70Q5T0N1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFAP70Q5T0N1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFAP70Q5T0N1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFAP70Q5T0N1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFAP70Q5T0N1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFAP70Q5T0N1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFAP70Q5T0N1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFAP70Q5T0N1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
CFAP70Q5T0N1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
CFAP70Q5T0N1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CFAP70Q5T0N1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CFAP70Q5T0N1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CFAP70Q5T0N1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFAP70Q5T0N1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFAP70Q5T0N1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFAP70Q5T0N1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFAP70Q5T0N1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFAP70Q5T0N1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CFAP70Q5T0N1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFAP70Q5T0N1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFAP70Q5T0N1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CFAP70Q5T0N1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
CFAP70Q5T0N1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CFAP70Q5T0N1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFAP70Q5T0N1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CFAP70Q5T0N1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CFAP70Q5T0N1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CFAP70Q5T0N1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CFAP70Q5T0N1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CFAP70Q5T0N1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CFAP70Q5T0N1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CFAP70Q5T0N1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CFAP70Q5T0N1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CFAP70Q5T0N1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFAP70Q5T0N1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFAP70Q5T0N1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CFAP70Q5T0N1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CFAP70Q5T0N1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CFAP70Q5T0N1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CFAP70Q5T0N1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CFAP70Q5T0N1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFAP70Q5T0N1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFAP70Q5T0N1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CFAP70Q5T0N1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CFAP70Q5T0N1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CFAP70Q5T0N1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CFAP70Q5T0N1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CFAP70Q5T0N1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CFAP70Q5T0N1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CFAP70Q5T0N1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFAP70Q5T0N1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFAP70Q5T0N1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CFAP70Q5T0N1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CFAP70Q5T0N1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CFAP70Q5T0N1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CFAP70Q5T0N1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CFAP70Q5T0N1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CFAP70Q5T0N1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CFAP70Q5T0N1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CFAP70Q5T0N1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFAP70Q5T0N1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFAP70Q5T0N1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
CFAP70Q5T0N1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CFAP70Q5T0N1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CFAP70Q5T0N1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CFAP70Q5T0N1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CFAP70Q5T0N1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CFAP70Q5T0N1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CFAP70Q5T0N1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CFAP70Q5T0N1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CFAP70Q5T0N1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFAP70Q5T0N1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFAP70Q5T0N1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CFAP70Q5T0N1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CFAP70Q5T0N1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CFAP70Q5T0N1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CFAP70Q5T0N1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CFAP70Q5T0N1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CFAP70Q5T0N1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFAP70Q5T0N1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFAP70Q5T0N1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFAP70Q5T0N1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CFAP70Q5T0N1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CFAP70Q5T0N1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CFAP70Q5T0N1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CFAP70Q5T0N1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CFAP70Q5T0N1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms