Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PERM1Q5SV97 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PERM1Q5SV97 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PERM1Q5SV97 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PERM1Q5SV97 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PERM1Q5SV97 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms