Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRB2Q5IJ48 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRB2Q5IJ48 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB2Q5IJ48 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRB2Q5IJ48 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms