Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SBK1Q52WX2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SBK1Q52WX2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SBK1Q52WX2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SBK1Q52WX2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SBK1Q52WX2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SBK1Q52WX2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SBK1Q52WX2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SBK1Q52WX2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SBK1Q52WX2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SBK1Q52WX2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SBK1Q52WX2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SBK1Q52WX2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SBK1Q52WX2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SBK1Q52WX2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SBK1Q52WX2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SBK1Q52WX2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SBK1Q52WX2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SBK1Q52WX2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SBK1Q52WX2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SBK1Q52WX2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SBK1Q52WX2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SBK1Q52WX2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SBK1Q52WX2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SBK1Q52WX2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SBK1Q52WX2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SBK1Q52WX2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SBK1Q52WX2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms