Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP21-2Q3LI59 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP21-2Q3LI59 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP21-2Q3LI59 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP21-2Q3LI59 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP21-2Q3LI59 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP21-2Q3LI59 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP21-2Q3LI59 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP21-2Q3LI59 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP21-2Q3LI59 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP21-2Q3LI59 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms