Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRTAP21-3Q3LHN1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KRTAP21-3Q3LHN1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KRTAP21-3Q3LHN1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRTAP21-3Q3LHN1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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