Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX4Q33E94 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFX4Q33E94 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX4Q33E94 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RFX4Q33E94 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms