Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDUFAF6Q330K2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFAF6Q330K2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFAF6Q330K2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFAF6Q330K2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFAF6Q330K2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFAF6Q330K2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFAF6Q330K2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFAF6Q330K2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFAF6Q330K2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFAF6Q330K2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFAF6Q330K2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFAF6Q330K2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFAF6Q330K2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFAF6Q330K2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFAF6Q330K2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFAF6Q330K2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFAF6Q330K2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFAF6Q330K2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFAF6Q330K2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFAF6Q330K2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFAF6Q330K2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFAF6Q330K2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFAF6Q330K2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms