Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTL8BQ17RB0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTL8BQ17RB0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RTL8BQ17RB0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTL8BQ17RB0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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