Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 RBM5-217ENST00000474818 832 ntTSL 34.02□□□□□ -1.772e-6■■■■□ 24.2
SRSF7Q16629 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.291e-7■■■■□ 24.1
SRSF7Q16629 PELP1-214ENST00000575329 3280 ntTSL 212.85□□□□□ -0.351e-7■■■■□ 24.1
SRSF7Q16629 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.481e-7■■■■□ 24.1
SRSF7Q16629 PELP1-211ENST00000573523 3878 ntTSL 211.58□□□□□ -0.561e-7■■■■□ 24.1
SRSF7Q16629 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.561e-7■■■■□ 24.1
SRSF7Q16629 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.581e-7■■■■□ 24.1
SRSF7Q16629 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.039e-14■■■■□ 24
SRSF7Q16629 KIZ-205ENST00000611685 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.98□□□□□ -0.339e-14■■■■□ 24
SRSF7Q16629 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.499e-14■■■■□ 24
SRSF7Q16629 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.589e-14■■■■□ 24
SRSF7Q16629 BRD9-210ENST00000493082 750 ntTSL 510.65□□□□□ -0.73e-6■■■■□ 24
SRSF7Q16629 KIZ-210ENST00000619189 2130 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.969e-14■■■■□ 24
SRSF7Q16629 KIZ-204ENST00000451772 536 ntTSL 37.23□□□□□ -1.259e-14■■■■□ 24
SRSF7Q16629 KIZ-207ENST00000616679 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.47□□□□□ -1.379e-14■■■■□ 24
SRSF7Q16629 KIZ-214ENST00000621366 1397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.07□□□□□ -1.69e-14■■■■□ 24
SRSF7Q16629 KIZ-201ENST00000419359 517 ntTSL 24.38□□□□□ -1.719e-14■■■■□ 24
SRSF7Q16629 KIZ-209ENST00000619179 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 53.87□□□□□ -1.799e-14■■■■□ 24
SRSF7Q16629 TBL1X-205ENST00000422314 496 ntTSL 219.02■□□□□ 0.641e-6■■■■□ 23.9
SRSF7Q16629 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.581e-6■■■■□ 23.9
SRSF7Q16629 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.761e-6■■■■□ 23.9
SRSF7Q16629 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.81e-6■■■■□ 23.9
SRSF7Q16629 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.821e-6■■■■□ 23.9
SRSF7Q16629 TBL1X-208ENST00000452824 387 ntTSL 59.08□□□□□ -0.961e-6■■■■□ 23.9
SRSF7Q16629 TBL1X-207ENST00000441088 520 ntTSL 35.73□□□□□ -1.491e-6■■■■□ 23.9
SRSF7Q16629 TBL1X-204ENST00000415293 565 ntTSL 55.73□□□□□ -1.491e-6■■■■□ 23.9
SRSF7Q16629 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.546e-7■■■■□ 23.9
SRSF7Q16629 TNS3-205ENST00000434451 560 ntTSL 512.99□□□□□ -0.335e-7■■■■□ 23.9
SRSF7Q16629 TNS3-207ENST00000450444 1832 ntTSL 511.22□□□□□ -0.615e-7■■■■□ 23.9
SRSF7Q16629 TNS3-203ENST00000415929 570 ntTSL 49.73□□□□□ -0.855e-7■■■■□ 23.9
SRSF7Q16629 TNS3-206ENST00000442536 1166 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.065e-7■■■■□ 23.9
SRSF7Q16629 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.565e-7■■■■□ 23.9
SRSF7Q16629 DCAF1-202ENST00000423656 5946 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.164e-7■■■■□ 23.8
SRSF7Q16629 DCAF1-203ENST00000504652 5951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.224e-7■■■■□ 23.8
SRSF7Q16629 PLXNB1-209ENST00000466353 626 ntTSL 314.58□□□□□ -0.088e-16■■■■□ 23.8
SRSF7Q16629 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 48.75□□□□□ -1.015e-7■■■■□ 23.8
SRSF7Q16629 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.197e-7■■■■□ 23.8
SRSF7Q16629 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.227e-7■■■■□ 23.8
SRSF7Q16629 SPON2-207ENST00000504871 581 ntTSL 420.09■□□□□ 0.814e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 SPON2-204ENST00000502483 571 ntTSL 419.48■□□□□ 0.714e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 C9orf3-207ENST00000445181 873 ntTSL 319.12■□□□□ 0.654e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.644e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 TFDP1-203ENST00000453989 792 ntTSL 318.77■□□□□ 0.64e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 C9orf3-209ENST00000460573 443 ntTSL 518.27■□□□□ 0.524e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 TFDP1-208ENST00000544902 1571 ntTSL 217.86■□□□□ 0.454e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 TFDP1-202ENST00000408980 866 ntTSL 517.6■□□□□ 0.414e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 C9orf3-216ENST00000478603 802 ntTSL 217.51■□□□□ 0.394e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 SPON2-220ENST00000515004 571 ntTSL 417.41■□□□□ 0.384e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.214e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 HP1BP3-210ENST00000438032 1159 ntTSL 515.68■□□□□ 0.14e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 415.02■□□□□ -04e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 TFDP1-206ENST00000475254 804 ntTSL 314.76□□□□□ -0.054e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 SPON2-212ENST00000509233 549 ntTSL 414.7□□□□□ -0.064e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.164e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 HP1BP3-208ENST00000424732 970 ntTSL 313.92□□□□□ -0.184e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 SPON2-215ENST00000511672 557 ntTSL 413.58□□□□□ -0.244e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 C9orf3-204ENST00000424143 1605 ntTSL 213.28□□□□□ -0.284e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 C9orf3-217ENST00000479161 942 ntTSL 512.47□□□□□ -0.414e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.424e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 SPON2-216ENST00000511679 556 ntTSL 511.84□□□□□ -0.514e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 TFDP1-205ENST00000465174 955 ntTSL 310.38□□□□□ -0.754e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 C9orf3-210ENST00000462125 961 ntTSL 310.34□□□□□ -0.754e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 SPON2-210ENST00000506266 462 ntTSL 410.29□□□□□ -0.764e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 TGFBR3-205ENST00000468996 569 ntTSL 48.19□□□□□ -1.14e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 HP1BP3-205ENST00000417710 572 ntTSL 57.21□□□□□ -1.264e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 HP1BP3-212ENST00000487117 1598 ntTSL 26.31□□□□□ -1.44e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.444e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 HP1BP3-207ENST00000419948 759 ntTSL 55.64□□□□□ -1.514e-7■■■■□ 23.7
SRSF7Q16629 TRRAP-203ENST00000417523 550 ntTSL 412.73□□□□□ -0.373e-46■■■■□ 23.5
SRSF7Q16629 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.43e-46■■■■□ 23.5
SRSF7Q16629 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.413e-46■■■■□ 23.5
SRSF7Q16629 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.443e-46■■■■□ 23.5
SRSF7Q16629 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.573e-46■■■■□ 23.5
SRSF7Q16629 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.583e-7■■■■□ 23.5
SRSF7Q16629 CTDSPL-204ENST00000435525 371 ntTSL 313.57□□□□□ -0.243e-7■■■■□ 23.5
SRSF7Q16629 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.123e-7■■■■□ 23.5
SRSF7Q16629 EHBP1-220ENST00000496857 1262 ntTSL 1 (best)8.86□□□□□ -0.992e-7■■■■□ 23.5
SRSF7Q16629 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.65e-7■■■■□ 23.5
SRSF7Q16629 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.715e-7■■■■□ 23.5
SRSF7Q16629 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.365e-7■■■■□ 23.5
SRSF7Q16629 SHANK2-215ENST00000470759 762 ntTSL 515.02■□□□□ -03e-8■■■■□ 23.4
SRSF7Q16629 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.753e-8■■■■□ 23.4
SRSF7Q16629 AGPAT3-213ENST00000479117 1510 ntTSL 515.07■□□□□ 06e-7■■■■□ 23.3
SRSF7Q16629 RBCK1-210ENST00000441733 961 ntTSL 514.07□□□□□ -0.162e-13■■■■□ 23.3
SRSF7Q16629 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.426e-7■■■■□ 23.3
SRSF7Q16629 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.56e-7■■■■□ 23.3
SRSF7Q16629 RBCK1-208ENST00000414880 765 ntTSL 311.08□□□□□ -0.642e-13■■■■□ 23.3
SRSF7Q16629 AGPAT3-215ENST00000484865 588 ntTSL 210.17□□□□□ -0.786e-7■■■■□ 23.3
SRSF7Q16629 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.826e-7■■■■□ 23.3
SRSF7Q16629 AGPAT3-211ENST00000467358 3955 ntTSL 28.84□□□□□ -0.996e-7■■■■□ 23.3
SRSF7Q16629 RBCK1-207ENST00000411647 593 ntTSL 37.64□□□□□ -1.192e-13■■■■□ 23.3
SRSF7Q16629 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.147e-7■■■■□ 23.2
SRSF7Q16629 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.087e-7■■■■□ 23.2
SRSF7Q16629 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.947e-7■■■■□ 23.2
SRSF7Q16629 ECI1-206ENST00000566379 961 ntTSL 217.28■□□□□ 0.367e-7■■■■□ 23.2
SRSF7Q16629 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.067e-7■■■■□ 23.2
SRSF7Q16629 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -07e-7■■■■□ 23.2
SRSF7Q16629 MFGE8-214ENST00000560937 801 ntTSL 214.8□□□□□ -0.047e-7■■■■□ 23.2
SRSF7Q16629 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.077e-7■■■■□ 23.2
SRSF7Q16629 MFGE8-205ENST00000558018 1989 ntTSL 214.47□□□□□ -0.097e-7■■■■□ 23.2
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