Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAPC1Q16533 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNAPC1Q16533 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNAPC1Q16533 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNAPC1Q16533 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
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