Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
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RAB30Q15771 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB30Q15771 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
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RAB30Q15771 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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RAB30Q15771 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB30Q15771 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB30Q15771 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
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RAB30Q15771 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB30Q15771 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB30Q15771 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB30Q15771 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB30Q15771 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB30Q15771 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB30Q15771 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB30Q15771 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB30Q15771 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB30Q15771 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB30Q15771 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB30Q15771 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB30Q15771 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB30Q15771 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB30Q15771 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB30Q15771 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB30Q15771 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB30Q15771 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB30Q15771 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
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RAB30Q15771 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
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RAB30Q15771 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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RAB30Q15771 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB30Q15771 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB30Q15771 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB30Q15771 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB30Q15771 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB30Q15771 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAB30Q15771 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB30Q15771 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
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