Protein–RNA interactions for Protein: Q15714

TSC22D1, TSC22 domain family protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1Q15714 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSC22D1Q15714 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSC22D1Q15714 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSC22D1Q15714 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC22D1Q15714 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms