Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRADDQ15628 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRADDQ15628 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRADDQ15628 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRADDQ15628 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRADDQ15628 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRADDQ15628 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRADDQ15628 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRADDQ15628 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRADDQ15628 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRADDQ15628 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRADDQ15628 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRADDQ15628 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRADDQ15628 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRADDQ15628 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRADDQ15628 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRADDQ15628 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
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