Protein–RNA interactions for Protein: Q15418

RPS6KA1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1Q15418 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPS6KA1Q15418 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPS6KA1Q15418 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPS6KA1Q15418 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
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