Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKD1Q15139 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKD1Q15139 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKD1Q15139 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKD1Q15139 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKD1Q15139 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKD1Q15139 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKD1Q15139 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKD1Q15139 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKD1Q15139 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKD1Q15139 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKD1Q15139 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKD1Q15139 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKD1Q15139 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKD1Q15139 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKD1Q15139 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKD1Q15139 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKD1Q15139 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKD1Q15139 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKD1Q15139 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRKD1Q15139 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKD1Q15139 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKD1Q15139 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKD1Q15139 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
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