Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAB3GAP1Q15042 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RAB3GAP1Q15042 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RAB3GAP1Q15042 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RAB3GAP1Q15042 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RAB3GAP1Q15042 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RAB3GAP1Q15042 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RAB3GAP1Q15042 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAB3GAP1Q15042 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAB3GAP1Q15042 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAB3GAP1Q15042 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAB3GAP1Q15042 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RAB3GAP1Q15042 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
RAB3GAP1Q15042 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RAB3GAP1Q15042 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RAB3GAP1Q15042 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RAB3GAP1Q15042 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RAB3GAP1Q15042 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RAB3GAP1Q15042 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RAB3GAP1Q15042 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RAB3GAP1Q15042 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RAB3GAP1Q15042 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RAB3GAP1Q15042 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RAB3GAP1Q15042 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RAB3GAP1Q15042 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RAB3GAP1Q15042 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RAB3GAP1Q15042 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RAB3GAP1Q15042 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
RAB3GAP1Q15042 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RAB3GAP1Q15042 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RAB3GAP1Q15042 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
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